圣彼得堡音乐学院成立于1862年，在杰出的世界著名的钢琴家和作曲家安东·格里戈里耶维奇·鲁宾斯坦的倡议下和积极组织下成立。
学院成立的第一年有179名学生，随后变超过200名学生。音乐学院的教授都是杰出的音乐家。圣彼得堡音乐学院的第一批毕业生都写进了世界文化史。其中有俄罗斯伟大的作曲家P.I.柴可夫斯基，1865年毕业于圣彼得堡音乐学院并获得银质奖章。刻在学校光荣榜上的第一个名字就是柴可夫斯基。
俄罗斯杰出的作曲家尼古拉·安德烈耶维奇·里姆斯基-科尔萨科夫（1844年-1908年）在学校的专业作曲和理论教育的形成上扮演了重要的角色，全方位地极大地影响了音乐学院的发展。
目前，圣彼得堡音乐学院设有6个系：作曲和指挥系、钢琴系、乐队系、声乐导演系、音乐学系、民乐系。音乐学院的教授和培养的人才享誉世界，有著名作曲家、导演、声乐家、钢琴家、管风琴演奏家、乐队表演家、歌剧导演、芭蕾舞导演、音乐学家。
21世纪初，音乐学院在继承前辈的传统的同时复兴起来。许多毕业生成为著名国际大赛的获奖者、在世界音乐舞台占有显著地位。众多教授们、研究生们和本科生们参加学校在校内、在许多其他国家举办的国际研讨会和大师班。经过多年的发展，学院与德国汉堡、德国德累斯顿、德国科隆、波兰弗罗茨瓦夫、荷兰鹿特丹、美国波士顿、英国伯明翰等其他地区的国际音乐名校保持良好的创作联络。2001年，确定筹办每年一届的“国际音乐学院周”文化节。
专为音乐学院，于1896年建造的芭蕾和歌剧剧院A.K.格拉祖诺夫小音乐厅是音乐学院引以为豪的历史名迹。
目前，音乐学生共有400多名教师、超过1000名学生。
从20世纪70年代开始，学院积极接收外国学生。目前，在音乐学院不同系别和项目下学习的外国学生超过250名，分别来自世界上38个国家。音乐学院的外国毕业生为世界各地所需求：在交响乐团演奏、在世界著名舞台上演出独唱/独奏节目、参与芭蕾舞剧和歌剧的演出，以及作为教师工作在各个音乐学院、音乐研究院和大学，继续俄罗斯文化传统和俄罗斯音乐教育工作。
